Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms