Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms