Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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