Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms