Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms