Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms