Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms