Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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