Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBRM1Q86U86 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBRM1Q86U86 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms