Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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