Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms