Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms