Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms