Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP53Q70EK8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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USP53Q70EK8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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USP53Q70EK8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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USP53Q70EK8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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USP53Q70EK8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP53Q70EK8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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USP53Q70EK8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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