Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEM1Q6ZVN7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms