Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms