Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCSAPQ6IQ19 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSAPQ6IQ19 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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