Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms