Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SAMD13Q5VXD3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SAMD13Q5VXD3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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