Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CEP170Q5SW79 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP170Q5SW79 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms