Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms