Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms