Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms