Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ISXQ2M1V0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms