Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MSMPQ1L6U9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms