Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms