Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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