Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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