Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NRF1Q16656 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NRF1Q16656 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NRF1Q16656 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NRF1Q16656 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NRF1Q16656 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NRF1Q16656 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NRF1Q16656 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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