Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RPE65Q16518 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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