Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS72Q15906 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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