Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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