Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITSN1Q15811 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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