Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms