Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDSNQ15517 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
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CDSNQ15517 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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