Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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