Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB35Q15286 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms