Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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