Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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COL4A6Q14031 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL4A6Q14031 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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