Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX2Q13950 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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