Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms