Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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FHL3Q13643 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FHL3Q13643 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FHL3Q13643 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FHL3Q13643 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FHL3Q13643 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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