Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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