Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms