Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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