Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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