Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms