Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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