Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PTPRJQ12913 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PTPRJQ12913 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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