Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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STX4Q12846 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STX4Q12846 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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